高内涵分析（High Content Analysis，简称HCA）是对高分辨率显微镜所拍摄细胞图像的自动提取和分析。高内涵，意味着丰富的信息。这些信息包括：单个细胞图像和各项指标，细胞群体的统计分析结果，细胞数量和形态的改变，亚细胞结构的变化，荧光信号随时间的变化，荧光信号空间分布的改变等等。还有助于人为偏差的消除。人们往往会选择比较好的细胞来拍摄和分析，而机器是客观的，所有样品的成像分析条件是完全相同的。高内涵分析可在培养细胞、组织切片甚至3D培养上开展。它有着广泛的应用，如药物筛选、多参数功能研究、化学基因组学、靶标验证和毒性检测等。

选择高内涵仪器时主要考虑以下三个方面：

1、成像速度
高内涵仪器和普通显微镜最本质的区别在于成像速度极大提高。但特别强调，虽然宽场荧光显微镜型高内涵比普通宽场荧光显微镜成像速度快，共聚焦型高内涵比共聚焦显微镜成像速度快，但共聚焦型高内涵未必比普通宽场荧光显微镜成像速度快，所以用户须根据实验的需要来选择适合自己的高内涵仪器。

2、图像质量和成像速度之间的平衡
科研用户既希望成像速度快，又希望图像质量好，可以考虑GE Healthcare的IN Cell 6000。它是以激光为光源的可变光阑线扫描共聚焦高内涵仪器，拥有专利的光学系统，成像完全可调：光阑打开的程度在1-3 AU之间可调，可以针对不同的需求调节共聚焦程度，达到成像速度和图像质量的优化组合。

3、图像分析软件
科研用户检测的指标复杂多样，除了基本的模块式分析工具，还需要有更强大的分析软件允许用户自主定义分析程序。GE Healthcare的高内涵平台除了基本的分析工具，还提供IN Cell Developer Toolbox 客户自定义分析软件，可以分析各种实验的图像结果。

2011年度细胞图像竞赛（IN Cell Analyzer Image Competition）

转自：生物通